东莞市烟草专卖局隶属广东省烟草专卖局和东莞市人民政府双重领导，依照《烟草专卖法》及其实施条例，实施烟草专卖行政执法职能。
主要职能有：（一）监督、检查、落实辖区烟草专卖法律法规及规章的执行情况；（二）组织指导并承办涉烟违法违规案件查处，打击假冒伪劣、走私烟草专卖品等违法行为；（三）承担相关专卖许可证件的核发、监督、管理工作；（四）依法宣传烟草专卖法律法规，开展市场监督管理，切实维护卷烟市场秩序，保护消费者、卷烟经营户的合法权益。